实验动物由于遗传变异和自然选择作用，即使同一种属动物，也有不同品系，经过采用不同遗传育种方法，可使不同个体之间在基因型上千差万别，表现型上同样参差不齐。因此，同一种属不同种系动物，对同一刺激的反应有很大差异。不同品系的小鼠对同一刺激具有不同反应，而且各个品系均有其独特的品系特征。例如DBA/2小鼠100%的可发生听源性癫痫发作；而C57BL小鼠根本不出现这种反应。BALB/cAnN小鼠对放射线极敏感；而C57BR/CdJN小鼠放射线却具有抗力。C57L/N小鼠对疟原虫易感，而C58/LwN、DBA/1JN小鼠对疟原虫感染有抗力。STR/N小鼠对牙周病易感，而DBA/2N对牙周具有抗力。C57BL小鼠对肾上腺皮质激素（以嗜伊红细胞为指标）的敏感性比DBA小鼠高12倍；DBA小鼠对雌激素（以乳腺变化为指标）比C57BL小鼠敏感。已经证明DBA小鼠的促进性腺素含量比A种小鼠高1.5倍，而C3H小鼠的甲状腺素含量比C57BL小鼠高1.5倍。摘除C57BL小鼠的卵巢对肾上腺无明显影响，但摘除DBA小鼠的卵巢却使肾上腺增大，对CE小鼠甚至引起肾上腺癌。乙烯雌酚可引起BALB/c小鼠的睾丸痛，而C3H小鼠则不能。