从基因水平研究发现，ζ和η链是同一基因的两种不同的拼接形式。ζ链由前1-8外显子编码，而η链是前1-7加上第9外显子编码。在遗传和结构上，与CD3γ、ε和δ三个亚单位不同，ζ和η链只有一个短的细胞外功能域（9个氨基酸残基）。ζ和η链在氨基酸水平的主要差异存在胞浆内，η链比ζ链多42个氨基酸残基，但缺少6个潜在的酪氨酸残基磷酸化位点中的一个。沁ζ、η和Fcεr Iγ多肽链共同表达于同一个细胞时，一个ζ亚单位可同ζ、η或Fcεr Iγ三个亚单位中的任何一个通过二硫键形成三种不同的二致辞体如ζ-ζ、ζ-η或ζ-Fcεγ（Ige Fc I型受体γ链），因此有人将ζ、η和FcεR Iγ链称之为ζ家族（ζfamily）。以TCRαβ多态型为例，可有TCRαβγεδεζζ或TCRαβγεδεηζ不同组合的TCR/CD3复合物，并可能共同存在于同一个细胞表面，把某一抗原与不同信号转导途径连接起来。

（一）ζ链

ζ链绝大多数以同源二聚体即ζ-ζ形式存在，仅有10%以异源二聚体（ζ-η）形式存在。ζ链是一种高度保守的结构，分子量为10kDa，从小鼠ζ链的cDNA推算出信号肽21个氨基酸残基，胞膜外区为9个氨基酸残基，穿膜区21个氨基酸残基，胞浆区113个氨基酸残基。目前已知，ζ链是一种受体激活的蛋白酪氨酸激酶底物，当受体与配体结合后，ζ链很快发生酪氨酸磷酸化，参与淋巴细胞活化信号的转导。用基因转染方法证实，ζ链胞浆内功能域具有将受体结合与细胞内信号转导途径连接起来的功能。目前发现，ζ链并非为TCR/CD3复合体所特有，它可以不依赖CD3的其它亚单位而存在于NK中，并同FcζγRⅢ（CD16）相连。此外，在TCR触发后，ζ链可以同一胞浆内称为ζ链相关蛋白70（ZAP-70）相结合，AP-70为一种胞浆内具有PTK活性的信号蛋白，含有两个SH-2（srchomology region 2,SH-2）结构域以及一个与猪脾中PTK syk相关的激酶结构域，ZAP-70分子中SH-2与ζ链中磷酸化的酪氨酸残基相结合，ζ链的酷氨酸磷酸化是由p59fyn或p56lck催化所致。

(二)η链

小鼠η链分子量为21kDa，可与ζ以异源二聚体形式存在。在人体细胞中至今还缺乏分子水平的证据来证明η蛋白产物及其在细胞中转录物的存在。采用不同探针在体外进行核糖核酸酶保护试验证明，人及某些哺乳动物有η样区产物表达，对其序列分析表明，η样区产物是ζ基因经选择拼接后所产生，但在人类η样区表达水平很低，仅有ζmRNA水平的0.25%.不同物种η样区基因在核苷酸水平高度保守,但由于读框改变使得它们在氨基酸水平无明显同源性。

表8-1 T细胞抗原受体复合体中的蛋白多肽