免疫增强药物的副作用一般较轻。卡介苗等局部应用的副作用是引起广泛的炎症反应性组织损伤。这种副作用与功能相关，难以避免。口服副作用较经，但疗效也降低，多糖类药物肌肉注射时有一过性发热等，一般均不影响治疗。

（一）恶性肿瘤

晚期肿瘤病人大多伴有免疫功能紊乱，在手术切除肿瘤后，使用免疫增强药物有利于调整机体的免疫功能，提高机体抗肿瘤作用，减少肿瘤的复发。在肿瘤放疗和化疗以后，机体免疫功能受到明显损害，使用免疫增强药物可以促进机体免疫功能的恢复。目前在肿瘤治疗中应和较多的免疫增强药物有卡介苗、香茹多糖、多抗甲素等。

（二）免疫缺陷病

先天性免疫缺陷病用免疫增强药物治疗没有明显的疗效。对某些继发性免疫缺陷，应用免疫增强疗法有一定的效果。实验研究发现，刺五加多糖、枸杞、当归补血汤等中药都可促进辐射损伤小鼠的免疫功能恢复，加速骨髓移植后造血与免疫功能的重建。在艾滋病的治疗中，一些中药方剂取得一定疗效。患者主观症状改善，CD4+T细胞比例上升等。

（三）传染病

一些感染性疾病，特别是慢性、反复性的病毒感染、真菌感染，往往都与免疫功能紊乱有关。应用免疫增强疗法，可以起到明显的辅助治疗效果。如左旋咪唑在治疗儿童上呼吸道反复感染，复发性疱疹性口腔炎等都有较好的效果。