目前检测多仍采用一此条件致病菌为间接指标。肠道传染病以大肠杆菌为指标，呼吸道传染病以溶血性链球菌为指标。肝炎病毒近年表面抗原，DNA聚合酶以及电镜观察，甲肝病毒分离等为指标。如消毒前后均未检出大肠杆菌或溶血性链球菌，则可以消毒后自然菌总数率低的百分率评价，消毒后自然菌总数下降80%以上为效果良好，降低70%为较好。减少60%以上为一般，减少60%以下为不合格。

具体检查方法：

1．物品表面检查 在消毒物品相邻部位划出2个10cm2范围，消毒前后别以无菌棉签采样，接种后培养24～48小时观察结果。

2．排泄物检查 消毒前后各取0.2ml排泄物的稀释液接种肉汤管，37℃培养24小时后再取样转种相应的培养基，24～48小时后观察结果。

3．空气消毒效果检查 一般用自然沉降法。消毒前后在消毒的空间不同平面和位置。放置4～5个平面，暴露5～30分钟后盖好，培育24～48小时观察结果。