许多疾病的分布表现出城乡差异。城市人口多，密度大，交通发达，流动性大，居住拥挤，呼吸道传染病如麻疹、水痘、百日咳、流行性感冒、流行性脑脊髓膜炎等病经常在大中城市中流行，一旦流行，传播迅速；如流行性感冒在一个大城市流行时，往往在两个月内便可涉及各个角落。城市儿童某些传染病的感染年龄比农村儿童提早。城市中工业集中，排放的烟尘及有害气体，加之汽车废气的排出污染空气，空气中有害物质浓度比农村高，因此，城市肺癌死亡率高于农村。

偏僻的农村和山区，人口密度较低，交通不便，流动性小，一些呼吸道传染病不易经常维持流行。有些偏僻山村，可多年没有水痘、麻疹、腮腺炎等病发生，若一旦传入，则可迅速蔓延，引起流行，此时年龄较大的儿童、青年、甚至成人亦可发病。农村因给水条件和饮水习惯等原因，肠道传染病发病率高于城市，疟疾、血吸虫病、钩虫病、丝虫病、钩端螺旋体病及某些虫媒传染病亦明显高于城市。