溶菌酶的主要功能是能溶解细菌表面的糖蛋白，具有抗感染的作用。也有人认为能增加吞噬细胞作用，能与各种阴离子分子形成复合物。高浓度溶菌酶能改善细胞膜的功能。溶菌酶的研究包括组织中的分布和血清中含量测定。有人对不同病态胃粘膜进行研究，发现除正常幽门腺细胞能合成溶菌酶外，其它胃腺体细胞均无此功能。表浅性胃炎时，胃体胃窦的颈粘液细胞开始具有分泌溶菌酶的功能。肠化生腺体中的潘氏细胞、杯状细胞、不典型增生的腺体细胞也能产生溶菌酶。作者推测可能慢性胃炎时细菌等感染机会增多，是机体局部产生的对感染的调节　反应。有趣的是在胃癌细胞中也发现溶菌酶而且分化程度越高，分泌溶菌酶功能越强。转移性胃癌细胞和胃腺瘤细胞增色能分泌溶菌酶。其机理还不清楚。

有人对肠道进行研究，发现正常小肠粘膜杯状细胞和潘氏细胞能分泌溶菌酶，但含量较低。间质内粒性白细胞和巨噬细胞也有溶菌酶。但是，正常结肠和直肠上皮细胞表面和粘液腺体隐窝细胞中没有溶菌酶，固有层有溶菌酶阳性粒性白细胞。在15例溃疡性结肠炎病人中7例在结肠的直肠上皮细胞胞浆出现溶菌酶，8例克隆氏病人中只有1例阳性。作者认为用免疫细胞化学方法进行溶菌酶的定位研究有助于克隆氏病和溃疡性结肠炎病人的鉴别诊断。也有人对结肠癌进行研究，认为溶菌酶的分布与胃癌相反，结肠癌分化越高，分泌功能越低、其机理尚不清楚。

血清溶菌酶浓度的测定也曾作为无并发症的溃疡性结肠炎和活动性克隆氏病的鉴别诊断指标之一。由于80%以上血清溶菌酶多来源于粒性白细胞，不论溃疡性结肠炎或克隆氏病都可能引起周围血管局部粒性白细胞、单核细胞和巨噬细胞增多，因此，血清溶菌酶含量受到影响的因素较多，特异性不高，诊断价值有待进一步研究。