原位分子杂交技术在电镜水平的应用，或简称为电镜原位分子杂交技术是基因表达在超威结构定位的一项极有前景的新兴技术。但要使之完善，还需要做许多工作。必须说明的是电镜原位杂交技术和光镜原位杂交技术一样必须设置对照实验组，对显示的结果的解释应持审慎的态度。一般应在重复多次实验的基础上才能得出对本实验的结论，不能只凭一次实验或一张电镜照片就勿忙结论。因原位杂交技术是高度敏感、高度特异性技术，影响因素很多。电镜原位杂交技术的影响和干扰因素更多。相信在不久的将来，随着电镜原位杂交技术的广泛应用，科技工作者将从实践中对本技术的实验流程不断完善并有更多的新的电镜原位杂交技术方法涌现。